WordPressをインストールした場合は自動的に設定してくれるそうですが、そうではない場合、XServerではドメインのサブフォルダという形のURLでもサブドメインの内容にアクセスできちゃいます。それを防ぐ設定をしてみました。WordPressをインストールする場合を除き、サブドメイン毎に設定が必要そうなので、覚書として。
XServerのマニュアルのサブドメイン関連項目( https://www.xserver.ne.jp/manual/man_domain_subdomain_setting.php )に「サブドメインのアクセスのみを許可して、ドメインでのアクセスを禁止する方法」があるので、それを実行するだけです。
具体的には、記載された内容のファイルを作成します。（ローカルで準備する段階ではファイル名の先頭をドットにせず、htaccessというファイル名にでもしておく。）それをそのサブドメインのルートに相当するディレクトリにFTP転送し、その後ファイル名を.htaccessに変更するだけです。
今日設定したサブドメインでは多分できていると思いますが、何一つファイルをアップロードしていないフォルダなので、ちゃんと確認していません。後で確認しなければ。